2022年8月16日,bmc plant biology期刊(if=5.26)在线发表了上海植物园木本花卉研究团队题目为integrative analysis of transcriptome and metabolome reveals flavonoid biosynthesis regulation in rhododendron pulchrumpetals的研究论文。
杜鹃花是杜鹃花属(rhododendron)植物的总称,具有极高的观赏价值,素有“木本花卉之王”的美誉,在世界园艺界占有重要地位。花色是杜鹃花最重要的观赏性状之一,花瓣中类黄酮化合物在花色呈现中起着决定性作用。关于杜鹃花瓣中类黄酮的种类、影响花色呈现的相关基因已有文献报道,但是关于杜鹃花类黄酮生物合成的调控机制尚不清楚,花色呈色机制缺少系统研究。本研究以锦绣杜鹃(rhododendron pulchrum)为实验材料,利用代谢组学和转录组学联合分析技术,鉴定了不同种类的类黄酮代谢物,分析了涉及类黄酮生物合成的差异表达基因(degs),首次构建了锦绣杜鹃不同花色中类黄酮生物合成的调控网络。
3种不同花色的锦绣杜鹃花瓣
代谢组分析共鉴定出101种具有显著差异的黄酮类代谢物,主要分为黄酮、黄酮醇、花青素、异黄酮、黄烷醇、二氢黄酮和查尔酮等7类,其中黄酮和黄酮醇类化合物是锦绣杜鹃类黄酮代谢产物的主要成分。转录组分析共获得61.84g clean reads,鉴定到7113个差异表达基因(degs),go富集分析在生物过程大类中注释到22个花青素条目和29个类黄酮条目,在分子功能大类中注释到2个花青素条目和1个类黄酮条目。kegg共注释有46个编码苯丙烷类及黄酮和黄酮醇类生物合成途径中关键酶的unigenes存在差异表达。同时筛选到与类黄酮生物合成相关的差异表达的转录因子,其中有14个被注释为myb相关基因,还发现了编码bhlh的12个基因等,这些转录因子可能参与了锦绣杜鹃花瓣中类黄酮的生物合成。
锦绣杜鹃不同花色的黄酮类差异代谢物
锦绣杜鹃3个比较组的kegg分析
转录组和代谢组联合分析发现,锦绣杜鹃紫花中chs、fls、f3’h、f3’5’h、dfr、ans、gt、fns、ifr和faomt基因表达存在显著差异。首次发现fns和ifr基因与锦绣杜鹃花色着色有关,fns基因以fnsi的形式存在,ifr基因及其相关代谢产物在紫色花中高表达。f3’h和f3’5’h表达上调,而4cl、dfr、ans和gt表达下调与粉色花着色相关,转录因子dreb亚家族也在粉色着色中起着重要的作用。在白色花中,chs低表达抑制了类黄酮的合成,同时f3’5’h、dfr和gt低表达抑制了色素的积累,从而使花瓣呈现白色。同时,wgcna分析进一步验证ans、fls、lar、fns、gt、4cl、f3’5’h、ifr、dfr、faomt和viodelphin-gt基因与花瓣着色相关。
3种不同花色锦绣杜鹃花瓣中类黄酮生物合成途径
锦绣杜鹃3种花色的基因共表达分析
该研究首次从转录和代谢水平解析了锦绣杜鹃不同花色的呈色机制,鉴定到了大量和花色呈色相关的基因、转录因子和代谢产物,构建了3种花色的类黄酮合成途径模型,以上结果揭示了锦绣杜鹃花瓣的着色机制和类黄酮代谢途径,为未来杜鹃花色定向育种提供了理论依据。
上海植物园夏溪高级工程师为第一作者,张春英教授为通讯作者,龚睿工程师参与了部分工作。该研究得到上海市科学技术委员会科技计划项目(20392000700)和上海市绿化和市容管理局科技攻关项目(g190303)的资助。
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